该质粒为温敏穿梭质粒，质粒结构中来源于 pBR322 的 amp r/ori/rop 区域允许该质粒在 E.coli(Escherichia coli，大肠埃希菌) 。

中进行复制和抗性筛选，而来源于 p E194ts 的温度敏感性复制子和来源于 pTV32ts 的cm r基因组成的区域则允许该质粒在金葡菌中进行复制和抗性筛选；转座子 Tn917 插入在质粒 pID408 中，ampr/ori/rop 区域插入在 Tn917 近末端处，以便于对转座子插入基因组的位置进行定位；此外，Tn917 上携带有 erm r基因，一方面可用于抗性筛选，另一方面 ERY(Erythromycin，红霉素)  可以用于 Tn917 转座作用的诱导，且 ERY 浓度与转座效率有密切关系。质粒 pID408 保存于 E.coli DH5α 中。